взято с гаи.ру, дуаю для кузова отличий нет
Dp:Для замены двигателя нужны следующие документы. 
-- сертификат соответствия с приложением, в котором указано с какими моделями 
автомобилей имеет право работать организация выдавшая сертификат, а в сертификате 
должно быть указано какие виды работ разрешены, как-то замена номерных агрегатов. 
-- заявление-декларация, выдаваемое организацией производившей замену двигателя (кузова). 
-- характеристика транспортного средства после внесения изменений в конструкцию 
транспортного средства. 
-- акт выполненных работ.(то же выдаёт организация выполнявшая работы). 
-- заявление на внесение изменений в конструкцию транспортного средства, подаётся в 
ГИБДД (при замене двигателя другой модели, например: был 21083 (карб), хотите 
поставить 21114 (впрыск). Если двигатель однотипный можно без заявления, но лучше написать, вопросов меньше задают, я всё в заявлении указываю (причину замены). 
-- справка из НАМИ разрешающая установку данной модели двигателя (если другая модель, 
см. выше). 
-- квитанция об оплате выполненных работ. 
-- документы подтверждающие законность приобретения двигателя (кузова) 
Когда будут собраны все документы и заменён двигатель (кузов) едете на диагностику, и вам выдают диагностическую карту, подтверждающую наличие заменённого двигателя (кузова). 
Потом едете в РЭО и заполняете заявление, как при регистрации, если меняете кузов, можете оставить свои старые номера. ГАЙ осматривает, ставит подпись, и вот тогда сдаёте все документы в окошечко. Квитанции и прочие док. как обычно. 
Все чистые бланки есть в ГИБДД в тех. отделе